Lilja est actuellement chef de l'un des départements d'inspection de l'Inspection des soins et de la protection sociale (Inspektionen för vård och omsorg). Il a précédemment occupé des postes de direction au sein de la Région de Jönköping (sud de la Suède), notamment en tant que directeur des services d'ambulance et chef de section et de préparation aux situations d'urgence.
Le FIHM (Försvarets inspektör för hälsa och miljö — Inspectorat de la défense pour la santé et l'environnement) est une fonction d'inspection indépendante au sein des Forces armées suédoises, chargée du contrôle dans des domaines tels que la protection de l'environnement et de la santé, la lutte contre les maladies infectieuses, la sécurité alimentaire, la protection des animaux ainsi que les soins de santé. La responsabilité d'inspection s'étend également à certaines activités de l'Administration des fortifications (Fortifikationsverket), de l'Administration des matériels de défense (Försvarets materielverk — FMV) et de l'Établissement de radiodiffusion des forces armées suédoises (Försvarets radioanstalt — FRA).