Lilja er i dag chef for en af tilsynsafdelingerne ved Inspektionen för vård och omsorg. Han har tidligere haft ledende stillinger inden for Region Jönköping (Sverige), blandt andet som driftschef for ambulancetjenesten og som sektions- og beredskabschef.
FIHM er en uafhængig tilsynsfunktion inden for Försvarsmakten og er ansvarlig for kontrol inden for områder som miljø- og sundhedsbeskyttelse, smittebeskyttelse, fødevaresikkerhed, dyrebeskyttelse samt sundheds- og sygepleje. Tilsynsansvaret omfatter også visse aktiviteter hos Fortifikationsverket, Försvarets materielverk (FMV) og Försvarets radioanstalt.